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一、已有方法的化合物检测一般流程：打开Analyst软件—激活LC/MS—执行(2)-执行（4）。

二、新化合物检测一般流程：打开Analyst软件—激活MS only—执行(1)—执行(3)-执行（4）。

（1）未知化合物检测方法的建立

1. 把50 ng/mL标准溶液放入注射器中放入质谱右侧面的针泵里，双击Analyst软件，双击Configure，点击MassOnly，点击activate profile，点击T图标，会听到喷气的声音，双击Manual Tuning，

2. 点击start syn.. pump

3. 在 Scan type里选择Q1 MS，在下方选择Postive或者Negtive，在Start - stop列表中输入扫描范围，要涵盖目标物

4. 点击start

5. 等稳定观察到待测物母离子时，不用在乎其它非待测物的离子响应高低（若目标物响应太低，可在compound列中将DP值调为50），点击stop

6. 选中Center/Width

7. 在center –width-列表中，分别输入母离子和宽度（一般为6）

8. 点击 Edti ramp，选中DP，点击OK，在MCA前面打勾

9. 点击start，查看左下图峰最高点对应的DP值，点击Stop，输入到左侧那一列compound的DP参数中，查看右下图中目标物的精确质荷比

10. 在 Scan type里选择Product ion，去掉Center/width前面的勾，在Start -stop列表中输入扫描范围：50 -母离子+3

11. 在Product of 后面输入刚才右下图中的精确质荷比

12. 点击 Edti ramp，选中CE，范围是5-80即可，点击OK，在MCA前面打勾

13. 点击Acquire，分别在Data file和Sample Name中命名，点击OK，查看右下图中最强的两个子离子

14. 在 Scan type里选择MRM，在Q1- Q3列表中输入母离子和子离子（输入两个最强的子离子），时间设置为100

15. 点击start，在右下图中点击右键，选择相对应的离子对，查看峰最高响应对应的CE值

16. 右键点击MRM列表，选中CE，将CE值输入到对应的离子对中

17. 点击左上角Source/gas，正离子： CUR: 25; CAD： 10； IS：5500； TEM：550； GS1：55; GS2：55；负离子CUR: 25; CAD： 10； IS：-4500； TEM：550； GS1：55; GS2：55

18. 点击保存，命名，关闭当前界面，点击view queue，点击standby（躺着的时间漏斗图标），点击T图标使之不处于显性状态，灭活MS软件，激活LC-MS软件，双击Build Acquisition Batch

19. 在set里输入文件名，点击add set，点击Add samples，在sample name的下方输入样品名，去掉后面的勾，在Data file下方Sub Folder命名（储存数据的子文件夹，一般输入年月，按时间归类），在Number后面输入样品数量

20. 在Method Editor左边的下拉菜单中选择第18步中命名的方法，点击method editor，右键点击Acquisition Method，点击add/remove device method，在对话框中全部打钩，点击OK，在右侧Synchronization Mode里选LC Sync，点击保存方法

21. 点击MRM，在d 内容过长，仅展示头部和尾部部分文字预览，全文请查看图片预览。 前面打钩，其它分析物不打钩并且在IS Name那栏点击选中内标(Name可自己修改，或默认也可)，Group列中将每个化合物的不同离子对归为1组，可命名为1

点击Next

在最下方填入单位如ng/mL，选中Apply units to all analytes

点击 finish

在Sample Type那列选中样品类型，标曲选standard，质控选Quality Control，其它默认Unknown

在Actual Concentration那列输入浓度的数值

点击左上角有峰形状的正方形图标可观看样品图谱，点击其右侧红斜线的图标可看标准曲线图

点击File，命名保存该结果列表

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