分离线粒体试验方法

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1.2.1提取线粒体DNA邋(mtDNA)逡逑

1)分离线粒体:采用邋Christian邋Frezza邋(Nat邋Protoc.邋2007;2(2):287-95.)描述方法,主要步骤包括:①准备预冷PBS和ffic,将己禁食12小时的C57BL/6小鼠放血处死,取出小鼠肝脏,去除胆囊,先用预冷PBS漂洗一遍后,用50ml预冷的IBc缓冲液漂洗5至6遍,直至漂洗液无明显血色。②用组织剪将肝逡脏剪碎(在冰上操作),滤去原EBc,加入5ml新鲜预冷IBc,将肝组织悬液转移至己预冷玻璃匀浆器中,均浆数次,直至液体均一、无明显组织块。③将肝组织匀浆液转移至15ml离心管,600g,邋4°C,离心lOmin;尽量吸净上清,转移至新的15ml离心管中,600g,邋4°C,离心lOmin;将上清转移至新的15ml离心管中,尽量避免吸到下层沉淀;7000g,4°C,离心lOmin;弃上清,用5ml预冷的IBc重悬并漂洗沉淀;7000g,4°C,再次离心lOmin;弃上清,沉淀即为线粒体。逡逑

2)所得线粒体沉淀按照每个肝脏加500叫缓冲液GS,重悬线粒体,用于进一步逡逑

提取mtDNA。采用血液基因组DNA提取试剂盒分别mtDNA,具体步骤包逡逑

括:将线粒体用200ulPBS重悬,加入200邋Proteinase邋K溶液,充分混匀;加入200ul缓冲液GB,充分颠倒混匀,56°C水浴lOmin;加入200^1无水乙醇,颠倒混匀后快速离心,使管壁液体脱离,将所得溶液全部转移入吸附柱逡逑CB3,邋13400g,室温,离心30s,弃收集管某某废液,将吸附柱CB3重新放入逡收集管某某;向吸附柱CB3中加入500叫缓冲液GD,13400g,室温,离心30s,弃收集管某某废液,将吸附柱CB3再次放入收集管某某;向吸附柱CB3中加入逡逑

700uT漂洗液PW,邋13400g,室温,离心30s,弃收集管某某废液,将吸附柱CB3放入收集管某某;用5000的漂洗液再次漂洗离心后弃收集管某某废液,将吸附逡逑

柱CB3重新置于收集管后,13400g,室温,离心2min,弃收集管某某废液,逡逑

将吸附柱CB3室温放置3-5分钟以挥发乙醇,但应避免吸附膜干燥;将吸附逡逑

柱CB3转入新的1.5ml邋EP管中,向吸附膜中间位置悬空滴入50^170°C预热逡的ddH20以洗脱mtDNA,室温放置5min,13400g,室温,离心2min,邋EP逡管某某所得即为mtDNA;吸出mtDNA保存,并重复洗脱步骤2次,重复上述逡逑步骤。逡逑

3)线粒体检测:检测mtDNA浓度和纯度:得到的mtDNA溶液按照1:邋20稀逡逑释后,采用分光光度计检测其浓度和DNA纯度,保证OD260/280在1.8至逡逑2.0之间;以小鼠18S为内参基因,利用小鼠mtCOI和小鼠18S特异性引逡逑

物,采用SYBR邋Green荧光定量PCR检测提取所得mtDNA溶液中mtDNA逡逑和核基因组DNA水平。根据realtime邋PCR所得出的小鼠mtCOI和小鼠18S的Ct值及2-ACt方法计算出该mtDNA溶液中核DNA的含量,保证基因逡组DNA比例小于0.1%.逑

(1)线粒体邋DNA邋(Mitochondrial邋DNA,mtDNA)逡逑

与基因组DNA截然不同的是,人mtDNA为超螺旋、双链、环状DNA分逡子,总长I6569bp,两条DNA链分别为重链(H链)和轻链(L链),共编码37个基因,包括2种rRNA邋(16SrRNA、12SrRNA)、22种tRNA和13种蛋白逡逑质亚基[45]。一般情况下,线粒体内mtDNA与转录因 内容过长,仅展示头部和尾部部分文字预览,全文请查看图片预览。 膜为主[50]。由于基因组DNA含有低频率、高甲基化CpG重复序列,并很少进入溶酶体,因此一般生理情况下,TLR9处于非激活状态。TLR9向溶酶体膜转逡逑移是TLR9活化的必要条件[51],因此细胞损伤、坏死、氧化应激等情况下释放逡逑入细胞外的mtDNA首先促进TLR9由ER向溶酶体转移,其后再与TLR9结合,逡促进下游MAPK的活化。TLR9的激活可以促进Myd88邋+邋Mai邋IRAK邋+TRAF6邋TAB、TAK1激活,后者一方面可进一步与IKK作用,促进NF-kB转录因子的活化,另一方面可促进包括p38、ERK和:WK等在内的多种MAPKs逡激活[52]。逡

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